دوره 17، شماره 5 - ( دو ماهنامه آذر و دی 1392 )                   جلد 17 شماره 5 صفحات 17-24 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Mehdi M, Darabi M, Biagowi S, Najafipour R, NaserpoorFarivar T, Darabi Amin M. Comparison of Real-time PCR fluorescent and non-fluorescent quenchers in standard amplification plots of delta-6 desaturase gene in PANC-1 cell line culture. J Qazvin Univ Med Sci. 2013; 17 (5) :17-24
URL: http://journal.qums.ac.ir/article-1-1484-fa.html
سهمانی مهدی، دارابی مسعود، بیاگوی شیما، نجفی پور رضا، ناصرپورفریور تقی، دارابی امین مریم. مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش Real-time PCRدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-6 دساتوراز در کشت سلولی رده PANC-1. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین. 1392; 17 (5) :17-24

URL: http://journal.qums.ac.ir/article-1-1484-fa.html


1- ، mdarabiamin@hotmail.com
چکیده:   (4998 مشاهده)

  زمینه: استفاده از خاموش­کننده­های غیرفلورسنت در روش Real-time PCR برای بررسی بیان ژن مناسب است.

  هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج Real-time PCR انجام شد.

  مواد و روش­ها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلول­های سرطانی پانکراس انسان ( (PANC-1 در فلاسک­های 75 سانتی­متری کشت و تکثیر شدند. سپس 106×3 سلول در پلیت­های 6 خانه­ای تحت تأثیر داروهای مؤثر بر سیگنال­های خاص درون سلولی قرار گرفتند و میزان تغییر بیان ژن دلتا-6 دساتوراز در شرایط یکسان، یک بار با خاموش­کننده فلورسنت و بار دیگر با خاموش­کننده غیرفلورسنت با روش Real-time PCR بررسی شد. داده­ها با آزمون آماری تی و براساس روش ΔΔCT با فرض کارآیی 100 درصد تحلیل شدند.

  یافته­ها: خاموش کننده­های فوق، با جذب متفاوت نشر گزارش­گر (Reporter) ، باعث تفاوت در نتایج حاصل از Real-time PCR شدند. پلات آمپلیفیکیشن هنگام استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت، دقیق­تر و میزان خط پایه ( Base line ) پایین­تر بود و به این ترتیب نسبت سیگنال به noise کاهش یافت. با استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت، به دلیل افزایش دمای ذوب (Tm) و کاهش اتصالات غیراختصاصی، میزان عددی دوره آستانه ( CT ) نیز کاهش یافت.

  نتیجه­گیری: با توجه به یافته­ها، استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت نسبت به فلورسنت مناسب­تر و جای­گزین بهتری برای خاموش کننده­های متداول، به خصوص در مطالعه­های تشخیصی آلل­ها و SNP (single nucleotide polymorphism) بود .

 

 

واژه‌های کلیدی: Real-time PCR، دلتا-6 دساتوراز، رده سلولی
متن کامل [PDF 287 kb]   (1812 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2019 All Rights Reserved | The Journal of Qazvin University of Medical Sciences

Designed & Developed by : Yektaweb