دوره 18، شماره 6 - ( دو ماهنامه بهمن و اسفند 1393 )                   جلد 18 شماره 6 صفحات 4-10 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Sekhavati M, Naserpor Farivar T, Esmaelizad M, Tadayon K. Application of RE-SNPs genotyping in phylogenic studies of Bacillus anthracis in Iran. J Qazvin Univ Med Sci. 2015; 18 (6) :4-10
URL: http://journal.qums.ac.ir/article-1-1735-fa.html
سخاوتی محمد، ناصرپورفریور تقی، اسمعیلی زاد مجید، تدین کیوان. کاربرد روش RE-SNPs در مطالعه های فیلوژنی باسیلوس آنتراسیس در ایران. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین. 1393; 18 (6) :4-10

URL: http://journal.qums.ac.ir/article-1-1735-fa.html


1- دانشگاه علوم پزشکی قزوین
2- موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی
3- ، Email:k.tadayon@rvsri.ac.ir
چکیده:   (4066 مشاهده)

  زمینه: علی­رغم این که امروزه SNP ژنوتایپینگ به عنوان روش استاندارد در مطالعه های تکاملی و همه­گیرشناسی آنتراکس مطرح است، اما به دلیل نیاز به تعیین توالی در این روش، امکان اجرای آن در آزمایشگاه­هایی که با محدودیت بودجه مواجه هستند، وجود ندارد.

  هدف: مطالعه به منظور بررسی امکان استفاده از آنزیم­های محدودکننده در اجرای سیستم SNP ژنوتایپینگ ون ارت Van Ert) ) انجام شد.

  مواد و روش­ها: این مطالعه کاربردی در سال 1393 در آزمایشگاه تحقیق و توسعه بخش واکسن­های هوازی دام­پزشکی مؤسسه رازی کرج انجام شد. به منظور شناسایی آنزیم­های محدودکننده مناسب جهت هضم لوکوس­های SNP ، قطعه­های مربوطه بر روی ژنوم سویه 34F2 باسیلوس آنتراسیس بررسی شدند. صحت نتایج با استفاده از تعیین توالی محصولات PCR تأیید شد.

  یافته­ها: از میان 13 لوکوس بررسی شده، 3 لوکوس به واسطه نوع SNP خود، توسط آنزیم­های محدودکننده قابل افتراق بودند. قطعه 560 جفت بازی مربوط به لوکوس A.Br004 در سویه استاندارد و جدایه حاد تحت تأثیر آنزیم BsmI قرار داده شد که دو قطعه با اندازه­های 336 و 224 جفت باز حاصل شد . در بررسی امکان اجرای روش، سویه استاندارد به واسطه نوع SNP خود توسط آنزیم شکسته شد.

  نتیجه­گیری: با توجه به یافته­ها به نظر می­رسد پس از تکمیل فرآیند تحقیق، RE-SNP تایپینگ روشی ساده و مناسب جهت اجرای سیستم ژنوتایپینگ ون ارت باشد و نیاز به انجام روش پرهزینه تعیین توالی مرتفع شود.

 

   

متن کامل [PDF 258 kb]   (1053 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: میکروب شناسی
دریافت: ۱۳۹۳/۲/۳۱ | پذیرش: ۱۳۹۳/۶/۱۹ | انتشار: ۱۳۹۳/۶/۱۹

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2019 All Rights Reserved | The Journal of Qazvin University of Medical Sciences

Designed & Developed by : Yektaweb