دوره 17، شماره 5 - ( دو ماهنامه آذر و دی 1392 )                   جلد 17 شماره 5 صفحات 4-9 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

kafshdouzi amin M, rahimi H, Gheibi N, karimipour M. Bioinformatic design and optimization of inhibitory peptides for Tropomyosin receptor kinase B in U266 cell line. J Qazvin Univ Med Sci. 2013; 17 (5) :4-9
URL: http://journal.qums.ac.ir/article-1-1467-fa.html
کفشدوزی امین مرضیه، رحیمی حمزه، غیبی نعمت الله، کریمی پور مرتضی. طراحی بیوانفورماتیکی و بهینه سازی پپتیدهای مهارکننده گیرنده تروپومایوزین کیناز B در رده سلولی U266. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین. 1392; 17 (5) :4-9

URL: http://journal.qums.ac.ir/article-1-1467-fa.html


، gheibi_n@yahoo.com
چکیده:   (4002 مشاهده)

  زمینه: گیرنده تروپومایوزین کیناز (Tropomyosin Receptor Kinas B, TRK B ) یکی از پروتئین ­ های سرطان­زاست .

  هدف: مطالعه به منظور طراحی و بهینه­سازی پپتیدهای مناسب جهت مهار TRK B انجام شد.

  مواد و روش­ها: این مطالعه پایه در سال 1391 در دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد، پس از طراحی کتابخانه پپتیدی با روش sequence tolerance و بهینه­سازی انرژی پپتیدهای طراحی شده با روش backrub در بسته نرم­افزاری Rossseta 3.3 ، پپتیدهای دارای حداکثر پایداری، براساس مقادیر backrub توسط نرم­افزار R انتخاب شدند. ساختار سه بُعدی پپتیدها با استفاده از روش دینامیک مولکولی تعیین و میزان اتصال این پپتیدها توسط نرم­افزار HADDOCK بررسی شد . پایدارترین پپتیدها سنتز و اثر سمی آن­ها با استفاده از آزمون MTT بر روی رده سلولی U266 مطالعه شد.

  یافته­ها: پپتیدهای طراحی شده از لحاظ انرژی و ساختاری کاملاً پایدار بودند و تمایل بالایی برای اتصال به TRK B نشان دادند. پس از سنجش بقای سلول به کمک روش MTT ضمن تیمار رده سلولی U266 با این پپتیدها بعد از 24 ساعت، غلظت مهار سلولی 50 درصد ( IC 50% ) پپتیدهای یک و دو 2/350 و 5/199 نانومولار به دست آمد.

  نتیجه­گیری: با توجه به یافته­ها، به نظر می­رسد مهار TRK B می­تواند به توقف رشد در این رده سلولی سرطانی منجر شود .

 

   

متن کامل [PDF 441 kb]   (1377 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بیوتکنولوژی

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA code

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2019 All Rights Reserved | The Journal of Qazvin University of Medical Sciences

Designed & Developed by : Yektaweb